O Instituto de Design de Proteínas (IPD, a equipe do Nobel de Química de 2024 David Baker) da Universidade de Washington e a NVIDIA lançaram em conjunto o RFD4-Proteina, um novo modelo unificado de design de proteínas, de código aberto sob licença BSD-3. Ele funde duas linhas técnicas — o RosettaFold Diffusion do IPD e o Proteina-Complexa da NVIDIA — otimizando simultaneamente a sequência de aminoácidos, a estrutura 3D de uma proteína e as moléculas com as quais ela interage, podendo dedicar mais computação aos designs difíceis, como o "pensamento" de um modelo de linguagem. Os benchmarks mostram taxas de sucesso de design computacional de 5 a 10 vezes maiores que as de modelos anteriores, gerando proteínas candidatas de 5 a 10 vezes mais rápido.
Mais convincente ainda é a validação em laboratório: uma equipe do Manchester Institute of Biotechnology (MIB) da Universidade de Manchester usou o modelo para projetar enzimas totalmente novas para a síntese do lenacapavir, um medicamento de prevenção do HIV, visando uma etapa-chave de formação de ligação amida. A reação é extremamente difícil porque a enzima precisa promover a formação desejada da ligação amida enquanto suprime uma reação competitiva com a água, presente em vasto excesso. De 67 designs computacionais, quatro mostraram atividade clara; o melhor converteu 79% de uma amina quiral volumosa no produto desejado, com alta seletividade para o enantiômero S necessário. Baker afirma que o modelo abrirá a porta para novas soluções em medicina, sustentabilidade, materiais e biotecnologia.
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