IPD 与 NVIDIA 联手开源 RFD4-Proteina:AI 蛋白设计提速,湿实验验证合成艾滋病预防药新酶

IPD 与 NVIDIA 联手开源 RFD4-Proteina:AI 蛋白设计提速,湿实验验证合成艾滋病预防药新酶

华盛顿大学蛋白设计研究所(IPD,2024 年诺贝尔化学奖得主大卫·贝克团队)与英伟达联合发布新一代统一蛋白设计模型 RFD4-Proteina,并按 BSD-3 协议开源。它融合了 IPD 的 RosettaFold Diffusion 与英伟达的 Proteina-Complexa 两条技术路线,可同时优化蛋白质的氨基酸序列、三维结构以及与之互作的分子,设计过程还能像语言模型的"思考"一样为难题分配更多算力。基准测试显示,其计算设计成功率比以往模型高出 5 到 10 倍,候选蛋白的生成速度也快了 5 到 10 倍。

更具说服力的是湿实验验证:曼彻斯特大学生物技术研究所(MIB)团队用该模型为艾滋病预防药物 lenacapavir 的合成设计了全新酶,专攻其中关键的酰胺键形成步骤——该反应极具挑战,因为酶必须在水大量存在的环境中精准促成酰胺键、压制竞争性副反应。67 个计算设计中 4 个表现出明确活性,最佳设计将 79% 的大位阻手性胺转化为目标产物,且对所需的 S 型对映体高度选择。贝克表示,该模型将为医药、可持续发展、材料与生物技术打开新的大门。

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