Talus Bio lance Ptarmigan-1
L'entreprise pharmaceutique native de l'IA Talus Bio a lancé Ptarmigan-1, présenté comme le premier modèle d'IA capable de prédire la liaison de petites molécules à l'ensemble du protéome humain sans recourir aux structures tridimensionnelles, et en a ouvert l'accès au public.
Points clés
- Se passer de la structure et lire directement la séquence: la découverte de médicaments par IA traditionnelle repose sur la modélisation 3D de « petites molécules insérées dans la poche d'une protéine », mais environ 40 % des protéines humaines (dont de nombreux facteurs de transcription et protéines régulatrices liés à des maladies) sont trop flexibles et n'ont pas de structure fixe à laquelle s'accrocher. Ptarmigan-1 supprime tout simplement l'étape de modélisation structurale.
- Meilleur que les méthodes traditionnelles lors des essais: lors d'une évaluation sur un ensemble d'inhibiteurs de STAT6 rendus publics (une cible validée des maladies inflammatoires, dont le site de liaison est désordonné et difficile à modéliser), Ptarmigan-1 a surpassé les méthodes fondées sur la structure pour le criblage de candidats-médicaments, alors qu'il n'avait jamais vu cette cible ni ces molécules pendant l'entraînement ; les nouvelles petites molécules découvertes ont été validées par un laboratoire tiers.
- Complémentaire plutôt que substitut: le PDG de l'entreprise explique qu'après le prix Nobel de chimie 2024 qui a consacré la prédiction de structure, la communauté scientifique se concentre de plus en plus sur « l'utilisation de la structure pour piloter la découverte » ; Ptarmigan-1 est une voie complémentaire pour l'autre moitié des protéines dont la structure ne peut être calculée.
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